Deze zuivering lag in de provincie Utrecht en werd door de gemeente Maarssen rond 1949 gebouwd. Tussen 1967 en 1982 is de zuivering uitgebreid en overgedragen aan de provincie Utrecht. Bij de oprichting van het hoogheemraadschap Amstel, Gooi en Vecht in 1997 is het beheer en onderhoud van de zuivering overgegaan naar AGV. In 2016 is besloten om de verouderde zuivering te sluiten. Het riool van Maarssen heeft vanaf 1 juni 2019 een aansluiting gekregen op de zuivering Leidsche Rijn van het Hoogheemraadschap De Stichtse Rijnlanden waarna de sloop van de oude zuivering kon aanvangen.

De bouw van deze zuivering begon in 1983. Op 9 mei 1985 werd de RI Groot IJpolder officieel in gebruik genomen om met name industrieel afvalwater in het westelijk havengebied van Amsterdam te zuiveren. In 1993 werd de zuivering uitgebreid en bij de ingebruikname op 18 maart is de naam veranderd in RWZI Westpoort. Vanaf 1997 werden de zuiveringstaken van de gemeente Amsterdam overgedragen aan het Hoogheemraadschap Amstel, Gooi en Vecht. Rond 2017 is een gedeelte van het kantoorgebouw gesloopt en zijn er op het terrein zonnepanelen geplaatst om bij te dragen aan de klimaatneutrale doelstelling van Waternet. Anders dan bij de meeste zuiveringen zijn bij de bouw langwerpige nabezinktanken t.b.v. aeratie ontworpen.

Deze installatie is gebouwd ter vervanging van een eerdere installatie in de voormalige Middelpolder, die in 1954 gebouwd was in opdracht van de gemeente Nieuwer-Amstel (Amstelveen). Het Zuiveringschap Amstel- en Gooiland nam in 1977 het eigendom van die eerdere zuivering over.
In verband met modernisering werd in 1992 een nieuwe zuivering op nabijgelegen terrein in bedrijf genomen. De gebouwen op het terrein hebben geblokte ontwerpen. Vooral de in het oog springende kubussen zijn kenmerkend. Vanwege steeds grotere lozingseisen is de zuivering in 2006 op kleine schaal gerenoveerd. In 2016 werd besloten tot een grote renovatie om het afvalwater van Amstelveen en Ouderkerk aan de Amstel effectief en efficiënt te kunnen blijven zuiveren.

Sinds 1961 hebben de gemeente Blaricum en Laren een Gemeenschappelijke Regeling Rioolzuiveringsinrichting Gooyersgracht. In 1965 werd er land rondom de Rioolwaterzuiveringsinrichting gekocht voor een uitbreiding tot een / van de RWZI. In 1976 nam het Zuiveringschap Amstel- en Gooiland de beheertaken over. Tussen 1979 en 1981 werd er een aanzet gegeven tot uitbreiding van de zuivering. In 1988 kocht het zuiveringschap de RWZI. Vanaf 1993 zijn vanwege verscherpte eisen nieuwe aanpassingen nodig geweest. Hiervoor zijn in 1996 vergunningen verleend.