Wanneer deze molen precies is gebouwd is onduidelijk. Vermoedelijk is de voorganger daarvan in het rampjaar 1672 vernietigd. In het gemeentearchief van Reeuwijk zijn aanwijzingen gevonden dat de huidige molen rond 1688 gebouwd is. De Oukoopse molen heeft tot 1969 de polders Oukoop en Negenviertel bemalen. In dat jaar werd de bemalingstaak overgenomen door een dieselgemaal. De molen wordt in 1970 gekocht door de Goudse Verzekerings Mij. NV., die het laat restaureren. In 1983 wordt de molen overgedragen aan de Rijnlandse Molenstichting en wordt de molen opnieuw gerestaureerd, waarbij het bovenhuis grotendeels werd vernieuwd. Op 19 juli 1989 ontstond er brand in de molen. Na de reparaties werd de molen op 12 oktober officieel in bedrijf gesteld. In 2019 werd de fundering van de waterlopen gerestaureerd.