In 1684 werd er een wipmolen gebouwd, ter vervanging van een molen uit 1666 die vermoedelijk door storm- of brandschade verwoest was. De molen bleef tot 1959 in bedrijf. Toen werd er een elektrisch gemaal gebouwd, dat de bemalingstaak van de molen overnam. De molen werd in eigendom overgedragen aan de gemeente Leiderdorp. De polder werd in 1972 opgeheven en langzamerhand werd de molen ingebouwd. In 2004 werd besloten om de molen elders een plek te geven. De molen werd op 9 februari 2006 in delen afgebroken en per schuit naar de werkplaats van fa. Verbij vervoerd. Pas in 2008 werd de molen verplaatst naar de gemeente Jacobswoude, om zo een getrapte bemaling te vormen voor de Doespolder, samen met de Doesmolen (die door verschillende peilverlagingen vrijwel droog kwam te staan). Op 15 december 2009 werd de Kalkmolen in de Doespolder geplaatst. Zodoende fungeert het tegenwoordig als de ondermolen van de Doesmolen.