De molen werd oorspronkelijk in 1644 gebouwd en was gelegen bij de Slaghsloot buiten de Marepoort te Leiden. Het was gebouwd ten behoeve van de verversing van de stadsgrachten. In 1693 werd deze molen door het stadsbestuur van Leiden verkocht aan de Hondsdijkse polder, omdat de voormalige poldermolen was afgebrand. Vanaf 1867 was de molen ook verantwoordelijk voor de bemaling van de Kooipolder. In 1955 werd geconstateerd dat de molen gerestaureerd moest worden. Pas in 1958 werd besloten om met deze restauratie te wachten en werd de bemalingstaak overgenomen door een dieselgemaal gelegen nabij de molen. In 1966 werd de molen verkocht aan de Rijnlandse Molenstichting. Hierbij werd de molen weer omgebouwd tot een binnenkruier, zoals het tot vermoedelijk 1793 was geweest. Het werk werd in 1981 opgeleverd. Ook in 2010 werden er enkele werkzaamheden aan de molen uitgevoerd.