Over de gehele periode 1938-1983 is de gemeente Heinenoord een zeer kleine organisatie geweest.
Zo kende de gemeente tijdens de opheffing per 1/1/1984 slechts zeven ambtenaren. Dit betekent dat men genoodzaakt was om een aantal werkzaamheden uit te besteden, daar er niet de capaciteit aanwezig was. Zo was Heinenoord aangesloten bij de Technische Dienst Hoekse Waard, waar alle werkzaamheden omtrent het bouwen van woningen werden gedaan.

De functies van burgemeester en gemeentesecretaris was in de gemeente Heinenoord een dubbelfunctie, dat wil zeggen dat deze functies door één en dezelfde persoon werden uitgeoefend. (inventarisnummer 46). J. de Zeeuw was burgemeester van 1911 tot 1942, hij werd opgevolgd door W. van der Ploeg (1942-1943, 1945-1946), A. Roodzant (1943-1945), L. J. den Hollander (1945-1946), C.J. van Bommel (1949-1965), P. Groeneweg (1965-1974), W. van ’t Veld (1974-1980) en L. Vleggeert (1980-1982). De belangrijkste stukken uit hun personeelsdossiers zijn te vinden in de inventarisnummers 38 t/m 45.
De personeelsdossiers van het overige personeel zijn ook bewaard gebleven (inventarisnummers 570 t/m 578).

De gemeente Heinenoord kende door de relatief kleine omvang geen omvangrijke organisatiewijzigingen, althans dit is niet uit de archiefstukken op te maken.

Wel kende de gemeente één aparte dienst: het waterleidingbedrijf (ook wel waterbedrijf genoemd). Het archief van deze dienst is als gedeponeerd archief opgenomen in de inventaris. Deze dienst werd officieel als dienst benoemd in 1931 en is opgeheven in 1968, daar zij per 1 januari 1969 samen met enkele andere Hoekse Waardsche waterleidingbedrijven opging in Stichting bronwaterleiding Hoeksche Waard te ’s-Gravendeel.

Verder kende de gemeente een vrijwillige brandweer en viel zij onder de Rijkspolitie – groep Klaaswaal.