Met de verovering door de Fransen en de instelling van de Bataafse Republiek wordt het bewind van de ambtsjonkers geheel omver geworpen. Het "soevereine volk" moet gaan regeren en niet meer de adel. Er moet op bevel van de nieuwe machthebbers een richter en een gemeenteraad (onder de naam van municipaliteit) gekozen worden. Het nieuwe bestuur wordt in september 1795 door de inwoners van het ambt Ermelo gekozen. Op 6 januari 1796 komt de municipaliteit voor de eerste keer bij elkaar. Als richter is gekozen de heer van Leuvenum, mr. Antonie Pieter van Westervelt. Zowel uit Ermelo als uit Nunspeet worden drie municipalen gekozen. Na enkele jaren wordt het aantal municipalen terug gebracht van zes naar vier. In deze tijd heeft het volk ook enige zeggenschap. In bepaalde situaties worden ze geraadpleegd.
Een deel van de bevolking, namelijk de grondbezitters (of eigengeërfden) kiest met elkaar de nieuwe ontvanger. Door twisten en verschil van mening op landelijk niveau wordt in april 1798 ook het oude ambt Ermelo opgeheven en de ambtsregering ontbonden. Als vervolg hierop wordt een gemeentebestuur van Nunspeet ingesteld, waarvan we overigens bijna geen gegevens hebben omdat hiervan slechts enkele stukken bewaard zijn gebleven. Deze nieuwe gemeente was een samenvoeging van de ambten Ermelo, Doornspijk en Oldebroek. De secretaris van dit ambt was Dries Hoefhamer, de vroegere scholt van Doornspijk en latere notaris te Elburg.
Na nog geen tien maanden wordt deze bestuurlijke indeling al weer vaarwel gezegd en komt het oude ambt Ermelo weer terug. Ook de bestuurders van vóór april 1798 keren terug. De zaken worden als vanouds voortgezet en gedurende enkele jaren verandert er weinig.

In 1802 verandert de inrichting van het bestuur opnieuw. Richter mr. van Westervelt is inmiddels benoemd tot baljuw (of drost) van de West-Veluwe en woont in die kwaliteit de vergaderingen van de raad bij. Er is inmiddels weer een scholt van Ermelo benoemd, mr. E.G. Ardesch. Het aantal municipalen wordt teruggebracht tot twee, één van Ermelo en één van Nunspeet. Dit geeft tevens de afnemende volksinvloed aan. In de periode tussen 1802 en 1810 wordt er slechts tien maal vergaderd. In deze periode is er tussen 1806 en 1810 sprake van een zelfstandig koninkrijk onder Lodewijk Napoleon. Vanaf juli 1810 valt Nederland weer rechtstreeks onder het Franse keizerrijk onder leiding van Napoleon Bonaparte.
Het ambt Ermelo wordt onderverdeeld in de mairie Ermelo en de mairie Nunspeet en tot 1812 is dezelfde persoon maire (burgemeester) van beide besturen. In beide dorpen staat een adjunct-maire de burgemeester terzijde. Op 1 januari 1812 worden beide delen van het voormalige scholtambt Ermelo definitief gescheiden. Beide krijgen hun eigen maire en een eigen municipale raad. In Ermelo bestaat deze uit zes en in Nunspeet uit vier personen. Na enige tijd worden beide raden uitgebreid tot zeven personen. Deze werkwijze wordt voortgezet tot december 1813, de maand waarin het Franse keizerrijk valt. De prins van Oranje keert terug en wordt de nieuwe Koning.