Het archief van de gemeente Jisp is geordend volgens de Basisarchiefcode, de zogenaamde zaaksgewijze ordening. Deze ordening bleek in de praktijk niet altijd goed te zijn toegepast. Tijdens de bewerking is deze ordening daarom waar nodig alsnog aangebracht. Daarnaast bleek de oorspronkelijke wijze van archivering niet altijd consequent. Zo zijn de aan- en verkopen in het kader van uitbreidingsplannen zowel in de algemene rubriek Eigendommen, bij de subrubrieken Verkopen en Aankopen ondergebracht als bij de rubriek Ruimtelijke ordening en volkshuisvesting, bij de subrubriek Uitbreidingsplannen. Bij de inventarisatie zijn alle aan- en verkopen bij de algemene rubriek Eigendommen ondergebracht.
De vernietiging van stukken vond plaats aan de hand van de Leidraad voor de selectie op vernietiging van archiefbescheiden van (inter)gemeentelijke organen en aan de hand van de Handleiding voor de opbouw van het bestuursarchief van de gemeente. Daarnaast werden dubbelen verwijderd, evenals concepten indien er een definitief stuk aanwezig was.
Tijdens de bewerking kreeg ook de materiële verzorging aandacht. Paperclips, nietjes en plastic mapjes zijn uit het archief verwijderd. De stukken zijn herverpakt in zuurvrije omslagen en zuurvrije dozen en de dossiers zijn voorzien van tabladen.
De verdere onderverdeling van de rubrieken in subrubrieken is in het algemeen gebaseerd op de Basisarchiefcode van 1952. De rangschikking van de dossiers vond in het algemeen plaats met behulp van de Basisarchiefcode van 1952 dan wel van algemeen naar bijzonder. Ook een alfabetische rangschikking komt voor, zoals bij de bouwvergunningen, op adres.