Het museum stelt de architectuur centraal in haar permanente expositie. Daarnaast organiseert museum Nagele wisselexposities waarin architectuur en beeldende kunst een belangrijke rol spelen. De permanente architectuurexpositie gaat in op de ontstaansgeschiedenis van Nagele en haar unieke plaats in de architectuurgeschiedenis van Nederland. De architecten van "Het Moderne Bouwen" verenigd in de collectieven als "De Acht"en "De Opbouw", hebben hun stempel gedrukt op Nagele.
Nergens in Nederland is een zuiverder voorbeeld van hun ideeën te vinden. De verhalen van ontwerpers als Rietveld, Merkelbach, Bakema, Van Eyck, Ruys en vele anderen spelen een belangrijke rol. In Museum Nagele is een schat aan documentatie te zien, met daarnaast indien men wil, een beeld van de realiteit door middel van een wandeling door het dorp zelf.