Gemaal De Lynden is één van de drie stoomgemalen die het Haarlemmermeer in de 19e eeuw droog maakten. Er vonden in de loop van de jaren natuurlijk wel de nodige aanpassingen plaats. Zo vond er bijvoorbeeld in 1893 vanwege de hoge kosten van onderhoud van het gemaal en het grote kolenverbruik een grote reconstructie plaats, waarbij De Lynden zijvleugels kreeg.
Gemaal Lynden was in de loop van de jaren stoom-, diesel en elektrisch gemaal. Uiteindelijk werd het in de loop van de tachtiger jaren van de 20e eeuw geheel geautomatiseerd en om redenen van efficiëntie in 2005 vervangen door een naast gelegen nieuw en bedrijfszeker gemaal met dezelfde naam. Eind 2012 is het gemaal door het Hoogheemraadschap van Rijnland overgedragen aan de Nationale Maatschappij tot Behoud, Ontwikkeling en Exploitatie van Industrieel Erfgoed (BOEi) dat het het gemaal zal restaureren en het ketelhuis een herbestemming zal geven als restaurant.