Over de geschiedenis van de archieven van de Rijksakademie van Beeldende Kunsten is zeer weinig bekend. Het archiefonderzoek leverde geen informatie op, bijvoorbeeld in de vorm van instructies of voorschriften, omtrent de archiefvorming of de wijze van ordening van het archief. Zeker is dat de achtereenvolgende hoogleraren-directeuren eindverantwoordelijkheid hebben gedragen voor de archiefvorming aangezien deze met de algemene leiding en verantwoordelijkheid voor de gang van zaken waren belast. *  Intern zal de archivering aan de administratie zijn gedelegeerd, maar hieromtrent werd in het archief geen nadere informatie aangetroffen. Aangenomen moet worden dat de archieven van de Rijksakademie en de Commissie van Toezicht altijd bij de instelling zelf hebben berust, in casu het gebouw van de Rijksakademie aan de Stadhouderskade, tot zij in twee gedeelten aan het Rijksarchief werden overgedragen. De eerste overdracht vond plaats op 23 juni 1978 en betrof 11 meter archief (1870-1927). De tweede overbrenging vondplaats op 7 juli 1992 toen 31 meter archiefmateriaal werd overgedragen (1928-1987). Het laatste archiefblok (1987-1997) werd niet overgedragen en bleef bij de Rijksakademie van Beeldende Kunsten berusten waardoor dit niet bij de huidige inventarisatie kon worden betrokken. * 

Op het Rijksarchief werd in 1992 door R. Jansen een begin gemaakt met het schonen van beide archieven (totale omvang 42 meter). Van het archief uit de periode 1928-1987 zonderde hij 12 meter ter vernietiging af. De vernietigingslijst was grotendeels gebaseerd op de 'Lijst van voor vernietiging in aanmerking komende archiefbescheiden Rijksuniversiteiten en Hogeschool'. De formulering van enkele algemene categorieën werd door hem overgenomen uit de 'Lijst voor vernietiging in aanmerking komende stukken in gemeentearchieven'. *  Er bestaan geen aanwijzingen dat toen uit het archiefbestanddeel 1870-1927 werd vernietigd. Het archief werd in 1992 in ongesplitste vorm door A. Zuurbier in een plaatsingslijst beschreven. Als basis voor de plaatsingslijst maakte hij gebruik van de inventaris van L.J. Groeneveld (1978) waarin het archief van de Rijksakademie van Beeldende Kunsten, 1870-1927, was beschreven. Als inleiding op de plaatsingslijst bleef de ongewijzigde inleiding van Groeneveld fungeren. Middels deze plaatsingslijst werden de archieven van de Rijksakademie en de Commissie van Toezicht (1870-1987) op studiezaalniveau toegankelijk gemaakt en omvatte 24.3 meter series en 5.7 meter dossiers / bundels en losse stukken.

In 1995 werd de beslissing genomen om de plaatsingslijst tot een definitieve inventaris om te werken. Als argument werd ondermeer aangevoerd dat het hier een archief betrof van aanzienlijk cultuurhistorisch belang. Het archief gaf inzicht in de opleiding, vorming en ontwikkeling van jonge kunstenaars die tussen 1870 en 1987 op de Rijksakademie waren opgeleid en waarvan velen een belangrijke bijdrage hadden geleverd, of nog leveren, aan de ontwikkeling van de Nederlandse beeldende kunsten. Evenzeer bleek de mate waarin het publiek het archief raadpleegde deze beslissing te rechtvaardigen. Een nieuwe inventaris was overigens zeker gewenst aangezien de plaatsingslijst het archief niet optimaal ontsloot. De bestaande inleiding van de hand van L.J. Groeneveld was onvolledig en voldeed niet aan de binnen de archiefdienst gestelde eisen. In de tweede plaats kon de plaatsingslijst geen optimale toegankelijkheid waarborgen. De beschrijvingen waren summier, evenals de indeling, terwijl een deel van de beschrijvingen niet specifiek genoeg was beschreven waardoor deze in een verkeerde rubriek waren geplaatst. In 1996 werd een begin gemaakt met de herinventarisatie van het archief.

Tijdens de inventarisatie bleek dat het archief van de Rijksakademie volgens een duidelijke systematiek moet zijn gevormd. De series bleken doorgaans duidelijk onderscheiden en van een eigen nummering en doorgaans van systematische toegangen voorzien. De interne ordening binnen de series kon hierdoor behouden, of gereconstrueerd, worden. De series notulen, correspondentie (ingekomen, minuten van uitgaande en ingekomen en minuten van uitgaande), agenda's, stamregisters, studentendossiers en puntenboeken zijn hier goede voorbeelden van. Ondanks deze duidelijke aanwijzingen van een systematische archiefvorming bleek het niet mogelijk om de oude orde in het archief, dus buiten de series, te herstellen. De wijze waarop de series en de ongenummerde losse stukken en dossiers onderling geordend waren bleef volstrekt onduidelijk aangezien eigentijdse toegangen niet waren overgeleverd.