Op 18 januari 1853 kocht mr. Marie Aert Frederik Henri Hoffmann samen met zijn vrouw Cornelia Adriana Groen van Prinsterer, grond met de bedoeling er een kleuterschool te laten bouwen. Mr. Hoffmann vroeg een vergunning aan bij de Gemeente Voorburg en die werd hem toegestaan, mits er een schoolreglement gemaakt zou worden en er toestemming zou komen van de Schoolopziener van het 1e district van Zuid Holland. Aan deze voorwaarden werd voldaan. Zijn dochter, Jacqueline Adrienne Henriëtte barones van Wassenaer van Catwijck, nam de stichting van de school van haar vader over.
Op 6 juli 1853 werd door Koningin Sophie, de beschermvrouwe, de eerste steen gelegd. Op 24 mei 1854 werd de school feestelijk door haar ingewijd.

In het testament van de oprichtster, baronesse Cornelia Adriana Hoffmann-Groen van Prinsterer, stond bepaald dat bij haar overlijden een bedrag van 44.000 gulden “ter onderhouding” naar de school zou gaan. Na haar overlijden in 1889 werd de Stichting Sophia bewaarschool in het leven geroepen. Het bestuur moest ter eeuwige dagen bestaan uit 4 vrouwen met de titel: regentessen (vrouwelijke bestuursleden). Een vereiste was dat deze dames belijdend lid waren van de Hervormde Kerk. In april 1890 werd dit aanvaard. Het schoolgeld voor de leerlingen was minimaal omdat de school over voldoende eigen middelen beschikte. De hoofdfunctie van het gebouw was Bewaarschool of Kleinkinderschool, zoals toen ook gezegd werd. De school stond onder toezicht van “de regentessen”. Deze dames verleenden ook financiële steun. Uit de jaren 1868, 1880 en 1908 zijn getallen bekend van respectievelijk 17, 30 en 42 leerlingen. In 1918 was het leerlingenaantal gegroeid naar meer dan 100. Er werd onderwijs gegeven volgens de Fröbel-methode.
In 1905 vierde men het 50-jarig bestaan en in 1920 werd een bazaar gehouden omdat de school in dat jaar in geldnood verkeerd.

In 1983 ging de school samenwerken met de Wassenaer Hoffmanschool aan de Parkweg en in 1985 startte het bestuur onderhandelingen met zowel de Emmaschool aan de Vijverhof als de Woelige Roef aan de Prinses Margrietsingel over een fusie. De fusie tussen de Sophiaschool, de Emmaschool en de Woelige Roef kwam toen tot stand. Op 24 juni 1986 werd de historische bewaarschool opgeheven in verband met de invoering van de Wet op het basisonderwijs. Deze wet bepaalde dat kinderen van kleuterscholen en lagere scholen worden opgenomen in één onderwijsinstituut voor kinderen van 4 tot 12 jaar (het primair onderwijs).