Den Andel ressorteerde tot 1942 onder de Gereformeerde Kerk Warffum. In 1942 besloten de kerkenraad van de Gereformeerde Kerk Warffum en de classis Warffum in te stemmen met het verzoek vanuit Den Andel een eigen kerkelijke gemeente te mogen stichten. Dat gebeurde op 29 november 1942, toen ook de leden van de kerkenraad werden bevestigd. Op 7 maart 1943 deed de eerste predikant W.H.J. de Boer zijn intrede. In 1926 was aan de Oosterweg een Evangelisatiegebouw verrezen, dat in 1942 in gebruik werd genomen als kerkgebouw. Daarnaast werd in 1948 de pastorie gebouwd. Den Andel bleef een kleine gemeente met rond 250 leden. In de jaren 60 zette de daling in. Na 1975 werd geen nieuwe predikant meer benoemd en werd de gemeente geleid door een kerkelijk werker met een deeltijd-aanstelling. In 1978 was het ledental gedaald tot 91 en werd het jaar daarop samenwerking met de Gereformeerde kerk te Pieterburen noodzakelijk. Beide kerken werden conform het besluit van 8 oktober 1987 per 15 augustus 1988 opgeheven. Op 7 augustus 1988 werd de laatste dienst in Den Andel gehouden. Kerk en pastorie werden verkocht. Zie ook toegang 2589 van de Gereformeerde Kerk te Pieterburen.