Het algemeen bestuur van de Stichting bestaat uit tien gewone leden en één adviserend lid. Van de gewone leden komen er drie uit de kring van het openbaar, drie uit het rooms-katholiek en drie uit het protestants-christelijk onderwijs. Het tiende lid wordt geacht het personeel van de door de Stichting opgerichte scholen te vertegenwoordigen. Het college van Burgemeester en Wethouders van Nieuwegein wijst één adviserend lid aan. Op voordracht van de schoolraad worden er van de tien gewone leden twee gekozen door het gemeentebestuur. Twee leden worden door de Stichting R.K. Onderwijs Jutphaas en de R.K. Scholenstichting Vreeswijk gezamenlijk gekozen. Twee leden worden door de Vereniging voor Christelijk Nationaal Schoolonderwijs te Nieuwegein en de Vereniging ter bevordering van protestants-christelijk onderwijs te Vreeswijk Sealthiël gezamenlijk gekozen. De gezamenlijke ouderraden kiezen drie leden. Eén uit de kring van het openbaar, één uit de kring van het rooms-katholieke en één uit de kring van het protestants-christelijk onderwijs. Het lid dat het personeel van de door de Stichting opgerichte scholen vertegenwoordigt, wordt gekozen door en vanuit het personeel. De gewone leden van het algemeen bestuur hebben zitting voor de tijd van drie jaren. Elk jaar treedt één lid af volgens een door dit bestuur op te stellen rooster. Het algemeen bestuur regelt en houdt toezicht op het onderwijs. Het stelt de instructie voor het hoofd en het verdere onderwijzend, bedienend en administratief personeel vast. Het benoemt, schorst en ontslaat het personeel. Tevens stelt het algemeen bestuur de bezoldiging en de arbeidsvoorwaarden van het bedienend en administratief personeel vast. Het voornoemd bestuur stelt ook een huishoudelijk reglement vast, dat geen bepalingen mag bevatten, die in strijd zijn met de statuten. Er wordt tenminste vier maal per jaar vergaderd.