Het district en de landgroepen vormden ieder op zich een archief, waarbij gewerkt werd op basis van een registratuurplan. Na de reorganisatie in 1994 bleek dat de archieven onder minder goede omstandigheden op verschillende lokaties waren ondergebracht. De archieven waren gedeeltelijk toegankelijk via dossierinventarissen. De archieven waren daarnaast vermengd geraakt met de archieven van andere groepen of met de archieven van de nieuwe organisatie. In 1995 werd door de korpsleiding van de Regio Noord- en Oost-Gelderland besloten dat de archieven van de voormalige gemeente- en Rijkspolitiekorpsen geselecteerd, geïnventariseerd en geschoond dienden te worden. De archieven werden daarvoor samengebracht bij het gemeentearchief van Apeldoorn. Zie voor meer informatie het Organisatieplan archiefbeheer (inv.nr. 296).

De werkzaamheden zijn in het kader van het project ‘Afbouw oude organisatie’ uitgevoerd door J.J. Oosterbroek, medewerkster van de voormalige Gemeentepolitie te Apeldoorn.

In een tijdsbestek van 3 jaar werden zowel de archieven van de Gemeentepolitie, als van de Rijkspolitie bewerkt. De omvang van de Rijkspolitie-archieven bedroegen in 1994 circa 740 strekkende meters, waarvan na afronding van de bewerking in 1997 circa 295 meter overbleef. Het archief werd met behulp van magazijnlijsten op district en landgroep toegankelijk gemaakt. Vanwege de verhuizing van het gemeentearchief werd het archief in 2003 overgebracht naar de archiefruimte van de regiopolitie in het districtskantoor aan de Vosselmanstraat te Apeldoorn. Voor die tijd werd opnieuw uit het archief vernietigd, zodat uiteindelijk circa 90 meter is verhuisd. Van de tweede vernietiging is geen verklaring van vernietiging opgemaakt met bijbehorende staat, maar het betrof dossiers met een looptijd tot en met 1991.

De reorganisatie zorgde voor een herindeling van de regio’s. Hoewel de archieven van de groepen Urk en Dronten vanuit het oude district Apeldoorn/Flevoland, formeel onder de Regio Noord- en Oost-Gelderland vallen, zijn deze ten behoeve van de regionale geschiedschrijving via de regio Flevoland overgedragen aan het Nieuw Land Erfgoedcentrum te Lelystad.

De archieven van Bergh, Gendringen en Wisch, welke formeel vielen onder het district Nijmegen, zijn gedeeltelijk overgedragen aan de Regio Noord- en Oost-Gelderland. Het betreft hier stukken die te maken hebben met de taakuitvoering van de politie, zoals processen-verbalen en dagrapporten. De beleidsstukken en dergelijke zijn overgedragen aan het Gelders Archief *  .

Archiefstukken die specifiek betrekking hebben op de nieuwe organisatie, zijn eveneens aan de nieuwe politieregio overgedragen.

In augustus 2005 is het archief in goede en geordende staat gebracht. De magazijnlijsten zijn omgezet naar een dossierinventaris en er heeft een beperkte herbewerking van de dossiers plaatsgevonden.

Oorspronkelijk werden dagrapporten ook opgenomen in het permanent te bewaren archief, maar volgens de gehanteerde selectielijst *  kunnen deze vernietigd worden, met uitzondering van de periode 1940-1945. Voor een tijdsbeeld zijn de naderhand aangetroffen dagrapporten alsnog opgenomen.

Bij de laatste bewerking is gebleken dat een deel van het archief te vroeg is vernietigd, wat helaas hiaten veroorzaakt in het resterende archief. De inventarislijsten zijn opnieuw gemaakt en voorzien van de juiste gegevens betreffende het jaar van vernietiging (zie inv.nr. 118).

In 2008 heeft de organisatie een nieuw gebouw betrokken. Bij de voorbereiding hierop, zijn nog diverse archiefdelen gevonden, welke naderhand zijn toegevoegd. Een belangrijke vondst hierbij is afkomstig van de groep Putten, die boeken met dagrapporten uit de periode 1940-1954 omvat.

Sport was binnen de organisatie dusdanig belangrijk, dat er een eigen sportvereniging werd onderhouden met een diversiteit aan sporten. Bestuur en leden waren afkomstig uit de organisatie en regelmatig werden wedstrijden georganiseerd met andere districten en regio’s.

Het zorgdragerschap van de archieven berust bij de minister van Justitie. Derhalve dienen de archieven te worden overgedragen naar het Rijksarchief in de provincie Gelderland, deel uitmakend van het Gelders Archief te Arnhem. Deze actie is uitgevoerd in 2011.