De archiefstukken zijn afkomstig uit de collectie van de ZOV, de Vereniging tot instandhouding en uitbreiding van de Zaanlandse oudheidkundige verzameling Jacob Honig Janszoon junior. De zoon van A. Pelt, M.A. Pelt uit Koog aan de Zaan, schonk de stukken in 1926 of 1927, samen met de archiefstukken van PA-0036 (het Natuur- en letterkundig gezelschap Overeenstemming door wetenschap). Misschien deed M.A. Pelt dit in zijn hoedanigheid van procuratiehouder (gevolmachtigde) van de N.V. Machinefabriek P.M. Duyvis & Co. * 
De ZOV schreef de archiefstukken van PA-0036 en PA-0037 in als één geheel: 'Archief van het Natuur- en Letterkundig Gezelschap Physica te Zaandam. Opgericht 1 juny 1854.' Gerrit Jan Honig, de conservator en bibliothecaris van de ZOV, noteerde daarbij ook welke soorten Hollands papier hij in de archiefstukken aantrof: van J. Honig & Zoon (inventarisnummers 1, PA-0036, en 13, PA-0037); van Van Gelder (inventarisnummer 2, PA-0036); van C. & J. Honig (inventarisnummer 3, PA-0036); van H.F. de Charro (inventarisnummer 4, PA-0037); en Hollands papier gemerkt H (inventarisnummer 8, PA-0037). * 

In 1973 zijn de archiefstukken uit de collectie van de ZOV overgebracht naar het gemeentearchief. *  Waarschijnlijk zijn toen, bij het maken van de plaatsingslijsten, de archiefstukken van het Natuur- en letterkundig gezelschap Physica gesplitst in twee afzonderlijke archieven: PA-0036 en PA-0037. Ook is toen de nummering van de archiefstukken enigszins gewijzigd en hebben een aantal losse stukken een eigen inventarisnummer gekregen. *  Het is niet meer terug te vinden, uit welke archiefstukken de inventarisnummers 3, 7 en 11 afkomstig zijn.

Net zoals het archief van het Natuur- en letterkundig gezelschap is het archief van het Natuurkundig gezelschap niet compleet. De bestuursnotulen (inventarisnummer 2) stoppen in 1877. Afschriften van uitgaande post, zoals de uitnodigingen voor de ledenvergaderingen, ontbreken, evenals de catalogi die werden opgesteld toen in de periode 1866-1870 de instrumenten werden uitgezocht, en de polissen van de verzekering tegen brandschade. Wel lijken de potloodaantekeningen in de oude catalogus (inventarisnummer 13) te verwijzen naar de selectie van instrumenten, die rond 1866-1870 plaatsvond. * 
Het archief werd oorspronkelijk bewaard in een kist. In de catalogus van boeken en instrumenten (inventarisnummer 13) wordt gesproken van 'een kistje met het archief'. Ook wordt 'een paket oude notulen & kwitantien' genoemd. Misschien verwijst dit naar het archief van PA-0036. *