De bewerking van het archief van de voormalige gemeente Wognum heeft in twee fases plaatsgevonden. Allereerst in het kader van de opleiding Voorgezette Vorming Archiefbeheer (VVA) van de Stichting Overheidsdocumentatie (SOD) door Peter Lakeman. In dat kader heeft er ook een vooronderzoek plaatsgevonden op basis waarvan een archiefbewerkingsplan is gemaakt. Gezien de omvang van het te bewerken archief en de beschikbare tijd is uiteindelijk een deelinventaris gemaakt. Deze deelinventaris bevatte beschrijvingen van een deel (12m1) van het secretariearchief.
In 2011 is aan ArchiefBC de opdracht gegeven om het bestand verder te bewerken en de inventarisatie af te ronden. Na de bewerking is de omvang van het archief 19,2 m1
In verband met de invoering van de code VNG per 01-01-1941 is gekozen voor 1941 als beginjaar van het te bewerken archief. Het eindjaar is 1978 omdat per 31 december 1978 de voormalige gemeente Wognum is opgeheven in verband met een herindeling. Het archief bevat wel stukken van voor 1941. Deze behoren tot het oud archief van de gemeente Wognum 1436-1940. Het betreft de inventarisnummers 1, 2 en 4, zijnde stukken met betrekking tot de vergaderingen van de gemeenteraad 1937-1940 en de inventarisnummers 489 t/m 494, 497 en 498, zijnde stukken met betrekking tot het kadaster 1878-1940. Anderzijds bevinden er zich stukken in het oud archief en in het archief van de huidige gemeente Wognum, zijnde de rechtsopvolger, die behoren bij dit archief. Bovenvermelde stukken bevinden zich in bestanddelen die niet fysiek gesplitst kunnen worden en zijn onder een blanco nummer opgenomen in de inventaris.
Stukken betreffende verpachting, pacht, verhuur en ingebruikgeving zijn in principe vernietigbaar. In overleg met het WFA is besloten om deze stukken te bewaren omdat er historisch interessante stukken bijzitten.

In die gevallen waarbij een splitsing van een dossier de zaak te veel uit elkaar zou trekken is bij de keuze in welk archief deze bescheiden moesten worden opgenomen als belangrijkste criterium de datum van het besluit van het archiefvormend orgaan gehanteerd. Om die reden bevat het archief ook stukken van na 1978. Het betreft de inventarisnummers 108, 123 en 129, zijnde stukken met betrekking tot verkopen van onroerend goed 1979-1980 en de inventarisnummers 517, 518, 520, 521 en 526, zijnde stukken met betrekking tot ruimtelijke ordening 1979-1981.
Er is voor gekozen om het jongste en oudste jaartal niet in de titel op te nemen om verwarring bij de gebruiker te voorkomen.
Bij de ordening van het inventarisschema is gekozen voor een indeling ‘algemeen-bijzonder’ omdat dit het meest aansloot bij de oude ordening volgens de basisarchiefcode van de VNG. Onder stukken van algemene aard treft u archiefbescheiden aan m.b.t. de vergaderingen van het bestuur. De stukken betreffende bijzondere onderwerpen zijn verdeeld in ‘organisme’ en ‘taakuitvoering’. Onder de rubriek organisme ontbreekt alleen de subrubriek ‘personeel’. De archiefbescheiden die hieronder geklasseerd worden zijn nog niet geïnventariseerd. Onder de rubriek ‘taakuitvoering’ treft u beschrijvingen van archiefbestanddelen aan die betrekking hebben op een deel van de taken van de gemeente. Beschrijvingen die ook onder een andere (sub)rubriek geplaatst konden worden zijn daar opgenomen onder een blanco nummer. Per (sub)rubriek is de chronologie van stukken bepalend voor de plaats binnen die betreffende (sub)rubriek. In enkele gevallen is een alfabetische volgorde gehanteerd.
De inventarisatie in het kader van de VVA-opleiding is gerealiseerd met behulp van het programma filemaker pro. Bij de aanvang van de bewerking in 2011 is het gehele bestand geconverteerd naar het bij het Westfries Archief in gebruik zijnde programma Maisflexis. Het resterende deel (6,5m) is hierin beschreven.