Selectie
De selectie ter vernietiging heeft plaats gevonden middels de vernietigingslijst van de waterschappen. (Lijst van voor vernietiging/bewaring in aanmerking komende archiefbescheiden van waterschappen van na 1935, Staatscourant 1993, nr. 69 d.d. 8 april 1993).
Na de herbeschrijving van het onderhavige archief zijn diverse stukken, die aan het wezen van het waterschap niet veel bijdroegen, toch nog vernietigd ook formeel, en wel: kohier van de omslag 1881/1882-1895/1896, 1939/1940-1969, met hiaten; cahiers ter inschrijving van afgegeven bevelschriften tot betaling, 1903-1930; kadastrale legger ca. 1965-1972, losbladig, en met losse bladen. (samen 1 doos).

Verwerving
In veel gevallen heeft het waterschap Westerkwartier de administratie c.q. de archieven van inliggende waterschappen al een jaar of langer overgenomen vóór de formele opheffing. Bij de overdracht waren vele archieven echter lang niet ‘volledig’ overgedragen; notulenboeken, kasboeken, leggers van gronden en (oudere) reglementen ontbreken geregeld.
In 1976 en 1996 zijn vele begrotingen en rekeningen van de inliggende waterschappen in het waterschap Westerkwartier ontvangen van het Rijksarchief in Groningen. Uit het archief van het waterschap Westerkwartier zijn ook veel archiefbescheiden onttrokken en middels het bestemmingsbeginsels weer geplaatst bij de archiefvormer. Van de voormalige Provinciale Waterstaat Groningen zijn enige tekeningen van de inliggende waterschappen ontvangen.
De voormalige waterschapsarchivaris van het waterschap Noorderzijlvest, drs. A.L. Hempenius heeft nadat het waterschap Westerkwartier in 1995 is opgeheven getracht om de archivalia van de inliggende bemalingswaterschappen in het waterschap Westerkwartier te verzamelen. Na een zeer arbeidsintensieve correspondentie zijn vele archieven veiliggesteld.
Het archief van het waterschap de Fanerpolder is incompleet aan Westerkwartier overgedragen. Zo ontbreken de notulen vanaf 1881 tot 1917; een schrale troost is dat ze al in 1943 niet meer aanwezig waren.
In 2014 werd het beheer van het archief ondergebracht bij de Groninger Archieven.

Aanvullingen
Voor dit archief worden geen aanvullingen verwacht.

Verantwoording van de bewerking
Een groot deel van de archieven is in 1998 en 1999 doorgenomen, waarbij verbeteringen zijn aangebracht in de beschrijvingen en de ingekomen stukken en andere algemene dossiers onder de loep zijn genomen en definitief beschreven.
De verpakking van stukken is in 2003/2004 verbeterd, en in 2005 is de definitieve indeling gemaakt. In april 2005 is genoteerd welke kadastrale kaarten (plano) in zeer omvangrijke en tegelijk uiterst zwakke portefeuilles waren geborgen; ze zijn opgenomen in de inventarissen, op de plano kaarten is het inventarisnummer in potlood aangebracht.
Daar de omvang van de archivalia van de afzonderlijke archiefvormers zeer klein is, is er per waterschap c.q. molen- en pomppolder geen bepaald archiefschema gevolgd.
Op 29 december 1835 is blijkens enige oude stukken een inventaris van het toen aanwezige archief van de Fanermolenpolder gemaakt; de meeste stukken daarvan zijn verloren geraakt.
Blijkens stukken uit de jaren (18)80-1890 zijn stukken genummerd geweest; een zodanig register is evenmin bewaard gebleven.
Het archief is ca. 1987 globaal beschreven. Bij die gelegenheid zijn, waarschijnlijk wegens het genoemde hiaat, bepaalde stukken bewaard en beschreven. Bij een toevallig onderzoekje in het archief van het waterschap bleek de beschrijving van de stukken op verschillende plaatsen te wensen over te laten, zeker wat betreft de omslagen met ingekomen stukken en diverse correspondenties. Vandaar dat ik het gehele archief opnieuw heb beschreven.
In het archief werden diverse losse stukken gevonden, die m.i. het bewaren waard zijn; daarmee en uit de 'verzamel'-stukken heb ik 18 nieuwe beschrijvingen gemaakt. Sommige afzonderlijk ingedeelde stukken heb ik weer bij elkaar gebracht, b.v. betr. de reglementering.
De omvang van het archief van het waterschap De Fanerpolder na bewerking is vier archiefdozen.

Ordening
Het is onmogelijk gebleken om retrospectief de registratuur en de berging van de archieven te reconstrueren.
Het archief is primair op onderwerp en secundair op chronologie geordend.