In 2004 is besloten het archief dat in 1998 was overgebracht naar Het Utrechts Archief te inventariseren. Gelet op de incompleetheid van het gedeelte vóór 1974 en op de fundamentele wijzigingen in de organisatiestructuur in dat jaar, is er voor gekozen om het archief van de Jongerenvereniging SSR in een aparte inventaris op te nemen. Tijdens de inventarisatie is besloten de archivalia van de diverse besturen, commissies, werkgroepen, secties en dergelijke te integreren in het archief van het hoofdbestuur. In het archief werden tevens enkele stukken van de Unie S.S.R. aangetroffen. Deze archivalia zijn overgedragen aan het Historisch Documentatiecentrum voor het Nederlands Protestantisme, verbonden aan de Vrije Universiteit van Amsterdam, om toegevoegd te worden aan het aldaar bewaarde archief van de Unie Societas Studiosorum Reformatorum. Ten slotte waren bij het archief ook enkele archivalia van de Commissie voor het Studium Generale van de senaat van de Rijksuniversiteit te Utrecht over 1955-1964 opgenomen. Deze stukken waren gevormd door leden van de afdeling Utrecht die lid waren van voornoemde commissie. Er is besloten deze stukken te integreren in het archief van voornoemde commissie, dat is opgenomen in het archief van de Rijksuniversiteit te Utrecht. Dit archief wordt eveneens bewaard in Het Utrechts Archief. Na verwijdering van dubbelen en vernietigbare stukken bedroeg de totale omvang van dit archiefgedeelte 3,3 m.

In 2007 is het archiefgedeelte, afkomstig van het Historisch Documentatiecentrum voor het Nederlands Protestantisme, geïntegreerd in de voorlopige inventaris uit 2004. Tevens werden de archivalia afkomstig van de Nieuwe Afdeling Utrecht der Societas Studiosorum Reformatorum te Utrecht en het Universiteitsmuseum te Utrecht in de inventaris beschreven. De rubriekenstructuur werd aangepast en er werden zowel nieuwe inventarisnummers gecreëerd als stukken aan bestaande nummers toegevoegd.
De onderhavige inventaris bestaat uit de hoofdrubrieken archief van het afdeling Utrecht en (bij dit archief) gedeponeerde archieven. De hoofdrubriek van het afdelingsarchief is vervolgens onderverdeeld in de subrubrieken archief van het Afdelingsbestuur 1906-1973 (1984), archief van het Sociëteitsbestuur (1922) 1945-1969, archief van de Arie Noordtzij-Stichting (1918) 1947-1973 en archief van de Organisatie van Reünisten der S.S.R. Afdeling Utrecht 1941-1961.

De stukken in het archief van het Afdelingsbestuur zijn voor het grootste gedeelte gevormd door de ab actis en vice-ab actis. Daarnaast werden als andere substantiële archiefvormers de praeses, de fiscus en de vicarius aangetroffen.
De stukken in het archief van het Sociëteitsbestuur zijn gevormd door de ab actis, de praeses, de fiscus en de culinarius.

Voor diverse stukken, in het bijzonder enkele financiële stukken, was niet altijd eenduidig vast te stellen of ze tot het Afdelingsbestuur, dan wel tot het Sociëteitsbestuur behoorden. Om die reden is besloten alle stukken te beschrijven onder het Afdelingsbestuur, tenzij met zekerheid vastgesteld kon worden dat de stukken tot het archief van het Sociëteitsbestuur gerekend konden worden.
Zo bevinden zich stukken over de exploitatie van de Sociëteit in de het Sociëteitsarchief onder de rubriek Exploitatie van de Sociëteit, maar moet hiervoor ook naar de stukken in het archief van het Afdelingsbestuur onder de rubriek Gezelligheidsvoorziening gekeken worden.

De inventarisatie werd in 2009 afgerond.

Uit het archiefgedeelte dat in 1986 werd overgebracht naar het Historisch Documentatiecentrum voor het Nederlands Protestantisme, verbonden aan de Vrije Universiteit van Amsterdam, werden onder meer diverse kwitanties en zogenaamde 'Berenboeken' vernietigd.

In een bijlage bij deze inventaris zijn lijsten opgenomen waarin gespecificeerd wordt van welke instelling (gedeelten van) inventarisnummers afkomstig zijn. Het archief is in zijn geheel openbaar. De uiteindelijke omvang van het archief van de afdeling Utrecht bedraagt: 17 m.