Het archief van dit betrekkelijk jonge waterschap is vrij compleet bewaard gebleven. Het enige dat duidelijk ontbreekt, zijn bouwtekeningen van het eerste stoomschepradgemaal dat in 1883/84 werd gebouwd. Deze zijn ook niet aanwezig in het archief van het waterschap De Slaag, dat formeel de bouw geregeld had. In dat archief bevinden zich wel enige andere stukken betreffende de bouw (inv.nr 45) en de correspondentie over de oprichting van het waterschap De Gecombineerde Stoombemaling (inv.nr 4). Ook het archief van het hoogheemraadschap De Bunschoter Veen- en Veldendijk bevat stukken zoals het rapport van ir E.F. van Dissel over de verplaatsing van het stoomgemaal na de ramp van 1895 (in inv.nr 74) en stukken betreffende de aanleg van de vleugelmuren voor de leidijken (inv.nr 774) en de bouw van het nieuwe stoomgemaal (inv.nr 775), die daarin terechtgekomen zijn vanwege de subsidieverlening voor deze werken.

Voor de ordening van het archief van De Gecombineerde Stoombemaling van de Zelderdsche Wetering werd hetzelfde schema gebruikt als voor de andere waterschapsarchieven uit de regio. Aan de hand van de Lijst van voor vernietiging in aanmerking komende stukken in de archieven van waterschappen, veenschappen en veenpolders, vastgesteld in 1955, werd uit de inv.nrs 23-25 een selectie gemaakt van vernietigbare stukken. De vernietigbare circulaires van de provinciale- en rijksoverheid e.a., aanwezig in alle waterschapsarchieven, werden verwijderd. Hiervan werd een aparte verzameling gevormd, waarin de stukken in enkelvoud zijn ondergebracht. Het archief heeft thans een omvang van 0,75 m1.