Het archief is niet compleet. Van vóór 1800 is alleen het rekeningboek 1638 - 1698/99 (inv.nr 30) overgebleven. Blijkens een vermelding in Johan van de Water's Groot Placaatboek .... 's lands van Utrecht (deel II p. 187) moet er een ouder register of rekenboek geweest zijn, waarin in 1644 de tekst van de schouwbrief van 1393 en van de ongedateerde dijkcedulle werden ingeschreven. In 1670 werd door de rentmeester en erfheemraad Johan van Zevender een memoriaalboekje ingevoerd voor de 'dagelicxe occurrentiën', dat ook niet meer aanwezig is *  . De door Gedeputeerde Staten ontslagen rentmeester Jan van der Coterlet weigerde in 1829 rekening en verantwoording te doen en de archieven over te geven *  . Van vóór die tijd zijn slechts enkele stukken bewaard gebleven *  .

Voor de ordening werd hetzelfde schema gehanteerd als voor de andere waterschapsarchieven uit de regio. Van een oude orde kon eigenlijk niet gesproken worden. Uit inv.nr 36 werden vernietigbare stukken geselecteerd volgens de Lijst van voor vernietiging in aanmerking komende stukken in de archieven van waterschappen, veenschappen en veenpolders, vastgesteld in 1955. De vernietigbare circulaires van de provinciale- en rijksoverheid e.a., aanwezig in alle waterschapsarchieven, werden verwijderd. Hiervan werd een aparte verzameling gevormd, waarin de stukken in enkelvoud zijn ondergebracht. Ingevolge besluit van dijkgraaf en heemraden van het waterschap Beoosten de Eem van 12 augustus 1942 vond vernietiging plaats van de staten van stemgerechtigde ingelanden behoudens die beschreven onder nummer 12 van deze inventaris, de processen-verbaal van kasopneming behoudens die vermeld in het achter de inventaris opgenomen proces-verbaal van vernietiging, en van de journalen van ontvangsten en uitgaven behoudens die beschreven onder inventarisnummer 37 *  . Het archief heeft thans een omvang van 0.75 m1.

Een verrassende aanwinst in 2011 vormde het notulenboek van het voormalige Waterschap De Slaag over juni 1873 - november 1881. Met de overige archieven van de rechtsvoorgangers van het Waterschap Beoosten de Eem (1929-1972) heeft dit boek lange jaren gelegen op de zolder van het pand Langegracht 23 in Amersfoort, waar het Hoogheemraadschap van de Bunschoter Veen- en Veldendijk vanaf 1890 kantoor hield. Toen het huis in 1955 door het bestuur van rechtsopvolger Waterschap Beoosten de Eem werd verkocht, zijn de archieven overgebracht naar het nieuw gebouwde polderhuis aan de Amersfoortseweg in Bunschoten. Dit boek was echter achter een balk gevallen en is over het hoofd gezien. Mevrouw Baukje Vellekoop, buurvrouw van de huidige bewoners van het huis aan de Langegracht, heeft het teruggevonden notulenboek van de ondergang gered en teruggebracht bij Archief Eemland, zodat de notulen van het bestuur van Waterschap De Slaag nu weer compleet zijn.