De selectie van het archiefbestand is uitgevoerd op basis van de Lijst van voor vernietiging/bewaring in aanmerking komende archiefbescheiden van waterschappen van na 1935 (Goedgekeurd bij ministeriële beschikking van 18 januari 1993, afgekondigd op 8 april 1993, Staatscourant nummer 69). De selectie is uitgevoerd op meso- of wel tabniveau, waarbij op tabniveau is beoordeeld of stukken in aanmerking kwamen voor bewaring dan wel vernietiging.
Sommige stukken die op basis van de Selectielijst in aanmerking kwamen voor vernietiging, zijn toch opgenomen in de inventaris indien ze voor de historie van het Zuiveringsschap Veluwe belangrijke en/of interessante informatie bevatten.

Na selectie bleef 35 m¹ over aan stukken die voor bewaring in aanmerking kwamen. Deze stukken zijn, conform de richtlijnen van het LOPAI, ontdaan van plastic en ijzeren hechtmechanieken en omgepakt in zuurvrije dossieromslagen en archiefdozen. Ze zijn overgebracht naar de archiefbewaarplaats van CODA te Apeldoorn, waar ze raadpleegbaar zijn voor geïnteresseerden. Deze dossiers zijn beschreven in onderliggende klassieke inventaris, waarbij van elk dossier een beschrijving is gegeven van de inhoud, de looptijd en een uniek volgnummer. De inventaris is opgesteld in het geautomatiseerde inventarisatieprogramma Mais Flexis van De Ree Archiefsystemen en vervolgens geconverteerd naar Word.
Voor de indeling van de inventaris is gebruik gemaakt van een archiefstructuur op basis van de Archiefcode van de Unie van Waterschappen (de zogenaamde Uniecode). Deze bevat vier niveaus, overeenkomstig de archiefstructuur die bij CODA in gebruik is. De archiefstructuur is aangeleverd door het Waterschap Veluwe en vervolgens aangepast naar het archief van het Zuiveringsschap.

Bij de selectie is een aantal dossiers aangetroffen waarvan de bewaartermijn op termijn zou verstrijken. Deze stukken zijn afgesteld op het voorgenomen jaar van vernietiging, te weten 2019, en teruggeplaatst in de archiefruimte van het Waterschap Veluwe. Deze stukken zijn beschreven op een VOT-lijst (vernietiging op termijn) in Excel. In totaal ging het om 10 cm¹.

De stukken waarvan op het moment van de bewerking het belang reeds was verstreken en die daardoor in aanmerking kwamen voor vernietiging in 2009 zijn beschreven op een vernietigingslijst, ter goedkeuring aan het College van Dijkgraaf en Heemraden (D&H) van Veluwe aangeboden in de vergadering van 22 juni 2009. Van de daadwerkelijke vernietiging van de stukken is een verklaring van vernietiging opgemaakt die in deze inventaris is opgenomen. De vernietiging is uitgevoerd door DataSpace te Eindhoven, onder waarborg van Doxis Informatiemanagers. De werkzaamheden met betrekking tot de daadwerkelijke vernietiging hebben plaatsgevonden volgens de strengste Europese normen DIN 32757-1 en Richtlijn 95/46/EG. In totaal is ruim 40 m¹ aan archiefbescheiden vernietigd.

Gedurende de selectie van de archiefbescheiden is de bestaande ordening van de stukken zoveel als mogelijk intact gelaten. Ook de bestaande structuur binnen dossiermappen is gehandhaafd, dossiers zijn daarom alleen waar nodig opgesplitst en/of samengevoegd. Indien nodig zijn tabstroken vervangen waar deze de inhoud niet dekten en/of in slechte staat verkeerden.

Indien in dossiers stukken van vóór 1972 aangetroffen (bijvoorbeeld stukken horende bij zuiveringstechnische werken overgenomen van gemeenten), dan zijn deze opgenomen in de inventaris, na overleg met medewerkers van Waterschap Veluwe. Stukken van ná 1996 (en dus opgemaakt dan wel ontvangen door het Waterschap) zijn buiten de bewerking gehouden en geretourneerd naar het archief van het Waterschap. Ook lozingsvergunningen die verleend zijn door het Zuiveringsschap, maar die op het moment van de bewerking nog vigerend waren, zijn in het beheer van Waterschap Veluwe gebleven ter latere verwerking.

Een aantal dossiers ontbrak op het moment van de bewerking uit het archief. Ook binnen de organisatie van Waterschap Veluwe waren ze niet terug te vinden. Deze dossiers zijn daarom buiten de bewerking gehouden:
- DB. Bezoldiging, 1977-1996 (-2.07.524)
- Garderen. Historisch dossier, 1963-1989 (-1.577.614.3)
- Rioleringsplan. Gemeente Oldebroek: Basisrioleringsplan voor de kernen Oosterwolde, Broekdijk, 't Loo, Wezep en Hattemerbroek, 1994-... (-1.777.674.121)
- Rioleringsplan. Gemeente Oldebroek: Hoofdgebied, 1993-... (-1.777.674.121)
- Rioolgemalen. Ederveen, 1977-1996 (-1.777.674.14)
- RWZI Elburg. Hinderwet / Wet Geluidshinder, 1991 (-1.777.674.18)
- RWZI Elburg. Hinderwet / Wet Geluidshinder, 1991-1992 (-1.777.674.18)

In april 2015 heeft Doxis Informatiemanagers een aanvulling toegevoegd. Deze bestond voornamelijk uit dossiers inzake rioolwaterzuiveringsinstallaties, rioolgemalen, bestemmingsplannen, lozingsvergunningen en rioleringsplannen. De looptijd van deze dossiers omvat de jaren 1972-1997. Dit archiefbestand was zaaksgewijs gevormd en geordend op basis van de Archiefcode van de Unie voor Waterschappen en volgens classificatienummer gerangschikt. De bewerking is geschied conform het archiefbewerkingsplan, derde concept d.d. 31 maart 2015. Er is geselecteerd op dossierniveau.