Het archief van PW over de periode 1865-1949 is in 1979 ddor de provincie overgedragen aan het rijksarchief. Het archief over de periode na 1949 berust nog bij de provincie. De cesuur is gelegd in 1949, omdat men in 1950 overging op een nieuw, zaaksgewijze archiefvorming (dossierarchief). Daarvoor gebruikte men een rubrieksgewijze ordening.

Het archief 1865-1949 verschillende eigentijdse toegangen (zie hiervoor de Tips voor onderzoekers), vervaardigd door de dienst ten behoeve van de archiefvorming en het eigen gebruik van het archief.

Een aantal van de kaarten bij het archief (zie toegang 1121) dateert van voor 1864, dus van voor de oprichting van de Provinciale Waterstaat. Dit is niet verwonderlijk: in 1864 was bepaald dat de hoofdingenieur van Rijkswaterstaat uit zijn archief alle stukken met betrekking tot de provinciale werken moest overdragen aan PW. Vreemder is dat het archief niet meer stukken van voor 1865 bevat. Blijkbaar heeft de hoofdingenieur niet erg meegewerkt en alleen een aantal kaarten overgedragen.

Het archief lijkt volledig, hoewel bekend is dat het in 1944/45 oorlogsschade heeft geleden. Onbekend is echter welke stukken toen verloren zijn gegaan. Na 1945 is de dienst tijdelijk gevestigd geweest in huize Angerenstein te Arnhem. Uit het archief is daar in1949-1954 al veel vernietigd, een noodactie, omdat de zolder ernstig overbelast dreigde te raken. Bij deze gelegenheid is geen gebruik gemaakt van de vernietigingslijst voor provinciale archieven van na 1850 uit 1952, en zijn ook voor blijvende bewaring in aanmerking komende stukken vernietigd. Dit werd niet als probleem ervaren omdat het archief van PW in vele gevallen een doublure is van het archief van GS. Tijdens de voorbereiding van de overbrenging naar het rijksarchief is het archief nogmaals geschoond. Hierbij zijn waarschijnlijk alleen maar dubbelen verwijderd, en werden de lijsten van stukken die bij de vorige vernietigingsoperatie waren opgesteld uitgewerkt tot een inventaris van vernietigde dossiers (inventaris
nummer 423).